MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015942	AC	3	6	3095792	3095797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7002	NC_015942	TGG	2	6	3095912	3095917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_015942	GCA	2	6	3095974	3095979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_015942	TCC	2	6	3097188	3097193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_015942	ACA	2	6	3097201	3097206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_015942	CATGC	2	10	3097276	3097285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7007	NC_015942	ATGGC	2	10	3097300	3097309	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7008	NC_015942	GCA	2	6	3097342	3097347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_015942	GCG	2	6	3097386	3097391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_015942	TGC	2	6	3097406	3097411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_015942	ACC	2	6	3097524	3097529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_015942	TGGC	2	8	3097719	3097726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7013	NC_015942	ATC	2	6	3097748	3097753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_015942	A	7	7	3097786	3097792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_015942	GTCC	2	8	3097835	3097842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7016	NC_015942	TTG	2	6	3098275	3098280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_015942	AGTC	2	8	3098900	3098907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_015942	TGG	2	6	3099128	3099133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_015942	GCA	2	6	3099190	3099195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_015942	TCC	2	6	3100404	3100409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_015942	ACA	2	6	3100417	3100422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_015942	A	6	6	3100492	3100497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_015942	CAG	2	6	3100533	3100538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_015942	GGT	2	6	3100553	3100558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_015942	GAT	2	6	3100567	3100572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_015942	GATA	2	8	3100633	3100640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_015942	AGG	2	6	3100717	3100722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_015942	TGA	2	6	3100723	3100728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_015942	ACT	2	6	3100780	3100785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_015942	ATA	2	6	3100851	3100856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_015942	A	7	7	3101051	3101057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_015942	ATG	2	6	3101145	3101150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_015942	TAA	2	6	3101165	3101170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_015942	GGC	2	6	3101214	3101219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_015942	AAG	2	6	3101220	3101225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_015942	AGTAA	2	10	3101302	3101311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_015942	ATT	2	6	3101315	3101320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_015942	CAAA	2	8	3101452	3101459	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_015942	A	6	6	3101457	3101462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_015942	ATAA	2	8	3101553	3101560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_015942	TTGG	3	12	3101654	3101665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_015942	AATA	2	8	3101708	3101715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_015942	GGA	2	6	3101757	3101762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_015942	AAACCA	2	12	3101846	3101857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_015942	AAC	2	6	3101927	3101932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_015942	GTT	2	6	3101996	3102001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_015942	T	6	6	3102167	3102172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_015942	ATT	2	6	3102250	3102255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_015942	GAAA	2	8	3102348	3102355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_015942	TGG	2	6	3102391	3102396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_015942	TGGCA	2	10	3102403	3102412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7052	NC_015942	AGA	2	6	3102553	3102558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_015942	A	6	6	3102607	3102612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_015942	TTC	2	6	3102785	3102790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_015942	T	6	6	3105343	3105348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_015942	TG	3	6	3105358	3105363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_015942	AGG	2	6	3105394	3105399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_015942	A	6	6	3106895	3106900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_015942	ACC	2	6	3107121	3107126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_015942	T	7	7	3107171	3107177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_015942	AAT	2	6	3108013	3108018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_015942	TTGT	2	8	3108029	3108036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_015942	CAT	2	6	3108530	3108535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_015942	ATC	2	6	3108976	3108981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_015942	AGCG	2	8	3109015	3109022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7066	NC_015942	GCG	2	6	3109041	3109046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_015942	TAG	2	6	3109053	3109058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_015942	GAA	2	6	3109089	3109094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_015942	AG	4	8	3113676	3113683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_015942	GCG	2	6	3113705	3113710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_015942	GCC	2	6	3113750	3113755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7072	NC_015942	A	6	6	3113805	3113810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_015942	CAA	2	6	3113825	3113830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_015942	TCT	2	6	3113902	3113907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_015942	TAT	2	6	3117315	3117320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_015942	CAC	2	6	3117452	3117457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7077	NC_015942	TCA	2	6	3117506	3117511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_015942	TAC	2	6	3117524	3117529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_015942	GTC	2	6	3117538	3117543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_015942	ATAA	2	8	3121043	3121050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_015942	AAT	2	6	3126794	3126799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_015942	GTTT	2	8	3127935	3127942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_015942	T	6	6	3127940	3127945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_015942	GCG	2	6	3129682	3129687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_015942	GCG	2	6	3133862	3133867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_015942	GC	3	6	3135837	3135842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_015942	TTC	2	6	3137681	3137686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_015942	ATC	2	6	3137712	3137717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_015942	GCA	2	6	3137758	3137763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_015942	TGG	2	6	3137774	3137779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_015942	GGT	2	6	3137823	3137828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_015942	CGT	2	6	3143493	3143498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_015942	GAT	2	6	3145726	3145731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_015942	A	6	6	3145740	3145745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_015942	CCA	2	6	3145798	3145803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7096	NC_015942	TTC	2	6	3146643	3146648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_015942	GAT	2	6	3146707	3146712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_015942	ATG	2	6	3146731	3146736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_015942	T	6	6	3146739	3146744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_015942	GAAC	2	8	3147334	3147341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7101	NC_015942	T	6	6	3147426	3147431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_015942	CCT	2	6	3150338	3150343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_015942	AGCA	2	8	3150392	3150399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7104	NC_015942	CAG	2	6	3150503	3150508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_015942	CGC	2	6	3150510	3150515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7106	NC_015942	TGGGCC	2	12	3150540	3150551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_015942	CAG	2	6	3150569	3150574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_015942	GA	3	6	3150627	3150632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_015942	ACCC	2	8	3150677	3150684	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7110	NC_015942	CTC	2	6	3151901	3151906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7111	NC_015942	AGT	2	6	3152360	3152365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_015942	ATTA	2	8	3152369	3152376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_015942	CTG	2	6	3152579	3152584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_015942	CAA	2	6	3152602	3152607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_015942	TGA	2	6	3152652	3152657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_015942	AAGG	2	8	3152790	3152797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_015942	TC	3	6	3152909	3152914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7118	NC_015942	AGG	2	6	3152943	3152948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_015942	G	8	8	3154695	3154702	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_015942	GGTC	2	8	3154716	3154723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7121	NC_015942	TAA	2	6	3154804	3154809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_015942	ATT	2	6	3154822	3154827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_015942	CAA	2	6	3154843	3154848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_015942	T	6	6	3154857	3154862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_015942	ATAG	2	8	3154867	3154874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_015942	CAA	2	6	3154882	3154887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_015942	AAC	2	6	3154913	3154918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_015942	AT	3	6	3154925	3154930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_015942	CAT	2	6	3154931	3154936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_015942	TTTTC	2	10	3154956	3154965	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7132	NC_015942	TA	3	6	3155239	3155244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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